Era na sala das Conclusões que se encontravam, até 1765, as imagens dos reis. Era também na sala das Conclusões que se reunia a comunidade do Mosteiro para ouvir os monges que acabavam a sua formatura em Teologia, no Colégio do Espírito Santo em Coimbra, e que vinham a Alcobaça defender as suas teses. Teses em que os candidatos à borla doutoral defendiam um certo número de ilações doutrinais, ou conclusões. Daí o nome de “sala das Conclusões”. Conforme a votação do júri, era concedido ou não, pelo padre abade, com a borla e o pergaminho, o título de doutor. Todos os anos eram assim criados um ou dois doutores. O teto da sala das Conclusões é todo pintado com motivos de brutesco, realçados a ouro, obra de Frei Luís de São José, que desenhou também, no início do século XVIII, o tecto da capela-mor da igreja da Misericórdia de Alcobaça e o da igreja do Mosteiro de Cós.
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